貓咪和人類一樣,生理上可分為男性和女性。不過除了基因上的差別,在貓咪界可能也存在著社會上的差異。根據ねこちゃんホンポ專欄作家指出,大致上可從已知的外觀、發情、疾病,以及行為和性格來比較。
毛色
貓咪的毛色和花紋,是由遺傳決定的,影響細節的基因則排列在染色體當中。貓擁有18對染色體加上1對性染色體,正常情況下應該有38條染色體。
女性的性染色體由2條X組成,男性則為1條X加上1條Y。製造棕色或黑色毛髮的基因位在X染色體上,因此同時具有黑色及棕色的三花貓或玳瑁貓,正常情況下都是擁有2條X性染色體的母貓。除非性染色體異常,一般情況下不會有公貓同時具有黑色及棕色。
體型
公貓通常比母貓大,體重也比較重。一般來說,公貓也比母貓擁有更大的臉。

公貓
公貓並沒有明顯的發情週期,只要附近有發情的母貓,牠可能就會出現發情的狀況。最顯著的變化是高舉尾巴,隨地尿尿。
母貓
發情中的母貓會發出與平常完全不同的叫聲,並以背部摩擦地面的方式吸引公貓。每次發情持續1~2周,若期間沒有成功受孕,可能在2周後再度發情。
公貓
泌尿系統是貓咪的常見疾病,公貓的尿道較長,需要特別注意導致膀胱和尿道結石的尿石症。其他如睪丸癌或前列腺肥大,都可以藉由結紮來預防。
母貓
常見的疾病有乳腺癌和子宮蓄膿,兩者都是危及生命的疾病,然而都可以透過絕育手術來預防。在第一次發情前進行手術,可以更有效的預防乳腺癌。

領地
公貓似乎比母貓更有領地意識,有報導指出公貓外出自由活動時,範圍比母貓更廣。
育兒
母貓會扶養小孩,甚至沒有血緣關係的母貓也會形成一個組織互相幫忙養育,反觀公貓基本上不參與育兒的工作。
獨立
母貓通常被認為更加獨立,畢竟一旦生下小貓,不得不扶養他們。有些人認為這可能是母貓傲嬌(ツンデレ)個性的原因。

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